Uni-Logo
Sie sind hier: Startseite Forschung Projektübersicht

Projektübersicht

Einzelzell-Drucker für die genomische und massenspektrometrische Analyse einzelner Bakterien (SiBaGeM)

Projektbild

Projektbeschreibung

Die Kultivierung zum Nachweis von Pathogenen verhindert in vielen Fällen eine schnelle und präzise Diagnose von Infektionskrankheiten. Zudem gilt der Großteil aller bakteriellen Spezies als nicht kultivierbar im Labor. Die Molekularanalyse auf Einzelzellebene erlaubt es Bakterien ohne zusätzlichen Kultivierungsschritt zu identifizieren und deren Genom zu analysieren. Sie birgt daher ein großes Potential, nicht nur für das Entdecken neuer Spezies und Gene, sondern auch für eine deutlich schnellere Diagnostik im klinischen Alltag. In SiBaGeM werden neue Dispensierchips und Assays für den am IMTEK entwickelten Einzelzelldrucker entwickelt, wodurch eine automatisierte Analyse einzelner Bakterienzellen auf Genom- und Transkriptomebene ermöglicht werden soll. Des Weiteren soll durch die gezielte experimentelle Untersuchung der für die Technologie maßgeblichen Tropfenentstehung neue Erkenntnisse geschaffen werden, für (i) die elektrostatische Neutralisation der Tropfen, (ii) die Tropfensortierung mit höherem Durchsatz, und (iii) die kontrollierte Kristallisierung einer MALDI Matrix für die nachfolgende Analyse einzelner Bakterien mit einem neuartigem Massenspektrometer. Das Ziel des europäischen Verbundprojektes SiBaGeM ist es ein Laborgerät für die Einzelzell-Genomik und ein Einzelzell-Massenspektrometer für eine schnellere Diagnostik von Infektionskrankheiten zu entwickeln.

Laufzeit

01.06.2016 bis 30.11.2018

Projektleitung

Julian Riba (Prof. Dr. Roland Zengerle)

Ansprechpartner/in

Julian Riba
Telefon:0761 203-73216

Kooperationspartner

Cytena GmbH, Freiburg Biosparq B.V., Amsterdam Medical Center

Finanzierung

BMBF - Eurostars Programm

Schlagworte

InkJet & Drucktechnologien, Analytik & Diagnostik, Mikrodosierung, Einzelzellanalyse, Genomanalyse, Sequenzierung, Massenspektroskopie, Medizinische Mikrobiologie, inkjet & printing technologies, analytics & diagnostics, microdosing, single-cell analysis, single-cell genomics, sequencing, mass spectrometry, medical microbiology
Benutzerspezifische Werkzeuge