Projekte
Robuste zentrifugalmikrofluidische Automatisierung der Anreicherung zur Identifizierung von Substrate von Proteasen (MiniNter)
Projektbeschreibung
Proteine bilden die funktionelle und strukturelle Grundlage von Lebewesen. Proteomik ist die systemweite Analyse von Proteinen, die typischerweise mittels Massenspektrometrie (MS) durchgeführt wird, um tausende von Proteinen in kleinsten Probenmengen zu identifizieren. Moderne Massenspektrometer sind äußerst leistungsfähig, aber die Probenvorbereitung hinkt in Bezug auf Robustheit und Reproduzierbarkeit weit hinterher. In diesem Projekt wird eine zentrifugalmikrofluidische Automatisierung der Probenvorbereitung für die MS-basierte Analyse von proteolytischen Prozessen erarbeitet. Die Proteolyse ist die enzymkatalysierte Spaltung von Proteinen in kleinere Fragmente.
Basierend auf unseren Erfahrungen in der zentrifugalen Mikrofluidik sowie in der Proteomik erwarten wir, dass die Automatisierung durch zentrifugale Mikrofluidik die Reproduzierbarkeit der gesamten Analysekette deutlich verbessert und gleichzeitig der Probenverbrauch minimiert wird. Wir beabsichtigen, die zentrifugalmikrofluidische Probenverarbeitung einzusetzen, um die wichtigsten Schritte von proteolytischen Prozessen bei klarzelligem Nierenzellkarzinom anhand wertvoller Patientenproben zu untersuchen.
Laufzeit
01.01.2019 bis 31.12.2021
Projektleitung
Dr. Tobias Hutzenlaub (Prof. Dr. Roland Zengerle)
Ansprechpartner/in
Dr. Tobias Hutzenlaub
Telefon:0761 203-73269
E-Mail:tobias.hutzenlaub@imtek.uni-freiburg.de
Kooperationspartner
Albert-Ludwigs-Universität Freiburg / Institut für Molekulare Medizin und Zellforschung / Prof. Dr. Oliver Schilling
Finanzierung
DFG
Schlagworte
Lab-on-a-Chip, lab-on-a-chip